La sensibilitat al gluten no celíaca es diagnostica en pacients en els quals hi ha evidència de que la simptomatologia que pateixen és causada per la ingesta de gluten, però se’ls ha descartat prèviament que siguin celíacs o que tinguin al·lèrgia al gluten.

A diferència de la persona celíaca, la persona sensible al gluten presenta els anticossos i els marcadors de susceptibilitat negatius, i les biòpsies duodenals realitzades els han sortit negatives o amb canvis mínims.
El diagnòstic es confirma quan, un cop descartada la celiaquia i l’al·lèrgia al blat, s’aprecia una millora en fer una dieta sense gluten i una recaiguda quan el gluten és reintroduït en la seva alimentació. El tractament és, per tant, una dieta sense gluten.